Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms