Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C17orf47Q8NEP4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms