Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF439Q8NDP4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF439Q8NDP4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms