Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DTX3Q8N9I9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DTX3Q8N9I9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms