Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MSL3Q8N5Y2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms