Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf62Q8N4C0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf62Q8N4C0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms