Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKAP2LQ8IYA6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKAP2LQ8IYA6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP2LQ8IYA6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms