Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2Q1Q7Z7E8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms