Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XIRP1Q702N8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP1Q702N8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms