Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A10Q6U841 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC4A10Q6U841 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms