Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC171Q6TFL3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms