Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC41PQ6P2S7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC41PQ6P2S7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms