Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETMD1Q6P1Q0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms