Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SUSD4Q5VX71 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms