Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
OBSCNQ5VST9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms