Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VSD8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms