Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NHSL1Q5SYE7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NHSL1Q5SYE7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms