Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PERM1Q5SV97 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PERM1Q5SV97 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms