Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC93Q567U6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms