Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CEP55Q53EZ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms