Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDCCQ504Y2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms