Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC38Q502W7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms