Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP13A4Q4VNC1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP13A4Q4VNC1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms