Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF3Q3KNV8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms