Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TWISTNBQ3B726 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TWISTNBQ3B726 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms