Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ISXQ2M1V0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ISXQ2M1V0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms