Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KNOP1Q1ED39 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KNOP1Q1ED39 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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