Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPROQ16827 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms