Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A3Q16572 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A3Q16572 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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