Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZFHX3Q15911 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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