Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABEP1Q15276 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABEP1Q15276 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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