Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRKQ15262 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRKQ15262 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRKQ15262 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
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