Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERC3Q15034 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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