Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms