Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPNMBQ14956 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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