Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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RBM39Q14498 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RBM39Q14498 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RBM39Q14498 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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