Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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SPIDRQ14159 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SPIDRQ14159 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SPIDRQ14159 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SPIDRQ14159 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIDRQ14159 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SPIDRQ14159 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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SPIDRQ14159 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SPIDRQ14159 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SPIDRQ14159 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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