Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PDE1CQ14123 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE1CQ14123 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms