Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms