Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC2Q13753 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMC2Q13753 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms