Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CDH18Q13634 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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