Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CUL1Q13616 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CUL1Q13616 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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