Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD1Q13562 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
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