Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SF3B2Q13435 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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