Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP140Q13342 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP140Q13342 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP140Q13342 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SP140Q13342 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SP140Q13342 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SP140Q13342 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SP140Q13342 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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