Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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