Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
GRIN2AQ12879 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
GRIN2AQ12879 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
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