Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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GTF3C1Q12789 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF3C1Q12789 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF3C1Q12789 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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