Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMOD3Q0VAK6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms