Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD47Q08722 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD47Q08722 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD47Q08722 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms